Implementation of the genome-informed risk assessment (GIRA) may lead to large disruptions to the health system
该研究利用宾夕法尼亚医学生物样本库数据评估了基因组指导风险评估(GIRA)的效用,发现其虽能有效识别大量高风险患者并预测患病率,但在预测新发病例方面表现减弱,且存在显著的种族和社会经济差异,表明若大规模实施 GIRA 可能会给医疗系统带来巨大挑战。
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该研究利用宾夕法尼亚医学生物样本库数据评估了基因组指导风险评估(GIRA)的效用,发现其虽能有效识别大量高风险患者并预测患病率,但在预测新发病例方面表现减弱,且存在显著的种族和社会经济差异,表明若大规模实施 GIRA 可能会给医疗系统带来巨大挑战。
该研究通过多组学分析在两个无 RET 突变的家族性甲状腺髓样癌家系中发现了一个新的 SLC30A9 基因内缺失突变,证实该突变通过翻译重起始机制产生 N 端截短蛋白,进而增强细胞增殖能力并驱动肿瘤发生,从而拓展了该疾病的遗传病因。
该研究通过整合性拮抗与拮抗多效性机制,解释了晚发性阿尔茨海默病风险等位基因在人群中的维持现象,指出这些等位基因可能通过降低男性癌症风险并增加女性患病风险而得以保留,从而为理解性别差异及优化精准医疗提供了新视角。
该论文指出,Shenhar 等人通过将具有显著遗传易感性的感染和意外死亡错误地归类为纯环境噪声并加以剔除,导致其关于人类寿命遗传率高达 55% 的结论存在严重的选择偏差,从而得出了与谱系研究和全基因组关联分析相悖的不可靠结果。
该研究证实,在短时间离心前处理并冷藏的条件下,临床化学常规检测中剩余的肝素分离血浆可作为循环游离 DNA(cfDNA)生物库和检测的可靠且未被充分利用的来源。
该研究通过构建迄今最大规模的细胞类型解析阿尔茨海默病基因调控网络图谱,揭示了由 NF-κB 枢纽介导的“稳态侵蚀 - 代偿抑制 - 病理升级”三阶段转录失调框架,阐明了 BCL6 介导的 NF-κB 抑制是认知韧性区别于痴呆的关键机制,并确立了 IRF8、BCL6 和 FLI1 作为干预靶点以延长代偿窗口期的潜力。
该研究利用英国生物银行数据发现,哮喘发病年龄与肺功能之间存在共享遗传因素,且这种遗传关联在早发型(≤20 岁)哮喘中更为显著,其影响主要通过 SLC22A5 和 C5orf56 等基因介导。
这项针对澳大利亚昆士兰地区的研究表明,通过实施儿科原发性免疫缺陷病(IEI)的常规化诊疗模式,显著减少了重复检测和意义未明变异,提高了知情同意率及诊断阳性率,从而优化了基因组检测的交付与服务效果。
这项针对 ASPREE 试验的回顾性遗传分析发现,基于甘油三酯的多基因评分能够识别出对阿司匹林反应截然不同的老年人群:评分最低者服用阿司匹林会增加出血风险且无心血管获益,而评分最高者则能同时降低出血和心血管事件风险,从而支持利用遗传信息优化阿司匹林在一级预防中的应用。
该研究提出了 EGRET 框架,通过联合建模顺式和反式遗传效应对基因表达的全基因组影响,显著提升了疾病关键基因的发现能力并有助于构建基因调控网络。
本文提出了一种名为 PheMED 的统计方法,利用 GWAS 汇总统计数据量化并校正由表型误分类引起的效应值稀释,从而解决生物库研究中因表型定义噪声导致的偏差问题,并提升了下游复制与遗传力分析的准确性。
这项基于法国 SeDeN-p3 研究的理论导向调查显示,尽管父母对扩展新生儿筛查(eNBS)和基因组新生儿筛查(gNBS)的接受度普遍较高,但这种支持是 nuanced 的,主要受预期健康益处、情感倾向及对不确定性的容忍度影响,并受到信任和社会距离的调节,因此未来的实施需要比例适当、文化适配的信息传播及明确的治理框架。
该研究提出了一种结合数据增强与可解释图神经网络的深度学习框架,有效解决了 RNA-Seq 数据高维小样本分类难题,并在肾癌等多种疾病数据集中实现了高精度分类与关键生物标志物的可解释性识别。
这项研究通过全基因组关联分析,在慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者和健康人群中鉴定出多个与运动能力、肌肉力量及疾病负担等肺外特征显著相关的遗传变异,揭示了这些表型的异质性部分源于先天的遗传易感性。
本研究利用苏格兰“世代”(Generation Scotland)队列,通过问卷调查收集了 1,180 名抗抑郁药使用者的临床数据以构建治疗反应表型,旨在通过后续结合电子健康记录验证及生物样本分析,揭示抗抑郁药疗效差异的生物学机制。
该研究利用饱和基因组编辑技术对 BARD1 基因进行了全面功能评估,成功解决了绝大多数意义未明变异(VUS)的临床分类难题,并进一步证实了 BARD1 在 DNA 同源重组修复及肿瘤抑制中的关键作用。
该研究通过深度表型分析和转录组测序,确认了 12 种罕见的双等位基因 RNU2-2 变异会导致一种以严重发育性癫痫性脑病为特征的新综合征,并提出了利用成纤维细胞进行 RNA 测序作为未来验证该变异的方法。
该研究利用 Oxford Nanopore 长读长测序技术,首次构建了涵盖 61 名中东及北非(MENA)个体的结构变异图谱,揭示了该地区特有的大量未报道变异,显著降低了 MENA 人群临床诊断中的变异解读负担,并为该区域人群建立了重要的结构变异参考资源。
这项研究验证了基于 67 个 SNP 的 1 型糖尿病遗传风险评分(GRS)在印度多中心队列中具有稳定的判别效能,但指出其表现受自身抗体状态和发病年龄影响,且欧洲来源的阈值会低估印度人群的遗传风险,因此亟需建立基于印度人群特征的优化阈值以提升临床诊断准确性。
该研究通过对 140 名经全外显子测序未能确诊的疑似线粒体病患儿进行 RNA 测序,发现其能将整体诊断率提升至 25%,揭示了 DNA 测序无法检测到的隐秘剪接、调控变异及无义介导的 mRNA 降解逃逸等致病机制,从而确立了转录组分析在神经代谢疾病分子诊断中的关键地位。